什么是熒光定量PCR?
指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個
PCR進程,使每一個循環變得“可見",最后通過Ct值和標準曲線對樣品中的DNA(or cDNA)的起始濃度進行定量的方法。
定量PCR原理?
與傳統PCR一樣,反應在溫度模塊里循環進行;理論上每經過一個循環目的基因的數量都會增加一倍;每個循環結束后,定量PCR儀器通過不同的濾光片記錄熒光信號;在擴增過程中,熒光信號隨著PCR產物的增加而增強。
定量PCR體系?
普通的PCR體系;模板,引物,dNTPs,buffer,Taq酶;加入各種類型的熒光染料。
在做Real time PCR時,對于SYBR Green I染料法和Taqman探針法都可以,但是二者有區別。SYBR Green I染料法是利用SYBR Green I結合雙鏈DNA來檢測PCR產物,可用于監測任意雙鏈DNA序列的擴增,但是必須考慮非特異性擴增。因成本相對低,是目前較常用的)。但是由于SYBRGreen I可以與所有的雙鏈DNA結合,包括非特異性的雙鏈DNA序列,因此可能會產生假陽性信號。
圖1:SYBR染(ran)料法(fa)原(yuan)理圖
Taqman探針法使用熒光探針檢測PCR擴增過程中產生的特異PCR產物:特異性熒光信號的產生,需要探針與目標序列進行特異性的雜交;探針可以標記不同的報告基團,因此可以在一個反應管中進行二條序列擴增完整的探針。5′端熒光基團吸收能量后將能量轉移給臨近的3′端熒光淬滅基團(發生熒光共振能量轉移);退火,探針與模板結合,引物在聚合酶作用下進行延伸反應,遇到探針時發揮3′-5′外切酶活性將探針切碎到反應體系中;報告基團與淬滅基團距離變大,在激發光的作用下發熒光。實驗結果重復性好,價格高。
圖(tu)2:TaqMan探(tan)針法原理圖(tu)
說了這(zhe)么多(duo),不知道小伙伴(ban)們(men)對qPCR的(de)理解是不是清晰多(duo)了呢(ni)?qPCR作為一種(zhong)簡單(dan)便捷的(de)定量技術,應該(gai)是小伙伴(ban)們(men)常用的技術了。雖然(ran)聽起(qi)來簡單(dan)但(dan)做起(qi)來卻沒(mei)有想象的那(nei)么簡單(dan),事(shi)實(shi)上,實(shi)驗室做一個(ge)樣(yang)本檢測QPCR需要(yao)1~2個(ge)小(xiao)(xiao)時(shi),這個(ge)時(shi)候不僅(jin)試劑盒(he)重要(yao),檢測能力也很重要(yao),希望(wang)這篇文(wen)章能幫助小(xiao)(xiao)伙伴們對(dui)QPCR有一個(ge)清晰的了解